Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms