Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms