Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NUP88Q99567 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms