Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SORT1Q99523 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms