Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPS6KC1Q96S38 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms