Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAPPC9Q96Q05 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms