Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
OPALINQ96PE5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.6 ms