Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNBD2Q96M20 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms