Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms