Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RUNDC1Q96C34 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms