Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NEIL2Q969S2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms