Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAPGEF4Q8WZA2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAPGEF4Q8WZA2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms