Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRIM41Q8WV44 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms