Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SVOPQ8N4V2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms