Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf40Q8IXQ3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms