Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC103Q8IW40 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCDC103Q8IW40 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms