Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IGDCC3Q8IVU1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms