Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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RAB11FIP4Q86YS3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP4Q86YS3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP4Q86YS3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP4Q86YS3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RAB11FIP4Q86YS3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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RAB11FIP4Q86YS3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RAB11FIP4Q86YS3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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