Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2Q1Q7Z7E8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms