Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT28Q7Z3Y7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT28Q7Z3Y7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms