Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
WDR88Q6ZMY6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms