Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LRIG3Q6UXM1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LRIG3Q6UXM1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms