Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM198BQ6UWH4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms