Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAF7Q6Q0C0 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms