Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REEP3Q6NUK4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms