Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRAMD4Q6IC98 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRAMD4Q6IC98 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms