Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RNF220Q5VTB9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms