Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q5VSD8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q5VSD8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q5VSD8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q5VSD8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms