Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HES3Q5TGS1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms