Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LGSNQ5TDP6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms