Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KCNT1Q5JUK3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms