Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TCTE1Q5JU00 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms