Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
WDR44Q5JSH3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms