Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TDRD12Q587J7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms