Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SFT2D3Q587I9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms