Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC92Q53HC0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms