Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf17Q53FE4 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms