Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC38Q502W7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms