Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SYTL3Q4VX76 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms