Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DUSP28Q4G0W2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms