Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RNF212Q495C1 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
RNF212Q495C1 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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