Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNAPC1Q16533 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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