Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALX1Q15699 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ALX1Q15699 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ALX1Q15699 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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ALX1Q15699 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ALX1Q15699 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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