Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIP13Q15645 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIP13Q15645 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms