Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SIX1Q15475 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SIX1Q15475 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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