Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RYR3Q15413 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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