Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 515.12■□□□□ 0.013e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.068e-7■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.098e-7■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 GDPD5-206ENST00000527820 3211 ntTSL 1 (best)12.56□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.738e-7■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 LRCH1-204ENST00000443945 2070 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.441e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.393e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 316.94■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 ASPSCR1-214ENST00000582404 534 ntTSL 315.89■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 RARRES2-204ENST00000478771 1907 ntTSL 221.15■□□□□ 0.982e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 RARRES2-203ENST00000467793 583 ntTSL 314.77□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 ZNF710-204ENST00000559419 332 ntTSL 315.35■□□□□ 0.052e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TNFRSF1A-212ENST00000539372 1063 ntTSL 217.73■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.033e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 PLD3-212ENST00000486134 327 ntTSL 212.29□□□□□ -0.443e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-201ENST00000352800 611 ntTSL 520.9■□□□□ 0.941e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-204ENST00000422442 564 ntTSL 517.37■□□□□ 0.371e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-203ENST00000422066 604 ntTSL 416.21■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-209ENST00000431421 550 ntTSL 416.21■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-217ENST00000626672 568 ntTSL 416.09■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-219ENST00000627825 312 ntTSL 516.09■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-210ENST00000431674 559 ntTSL 415.89■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-213ENST00000450267 588 ntTSL 315.89■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-202ENST00000413084 592 ntTSL 415.59■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-206ENST00000427349 554 ntTSL 315.59■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-214ENST00000457928 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-224ENST00000635794 768 ntTSL 56.96□□□□□ -1.31e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TBL1XR1-221ENST00000630833 567 ntTSL 44.59□□□□□ -1.671e-6■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.914e-34■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 NPTN-208ENST00000565282 1247 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.152e-8■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 NPTN-210ENST00000567198 571 ntTSL 412.49□□□□□ -0.412e-8■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 CTIF-206ENST00000588345 584 ntTSL 316.91■□□□□ 0.38e-8■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 CTIF-209ENST00000591387 859 ntTSL 216.82■□□□□ 0.288e-8■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 CTIF-203ENST00000587752 683 ntTSL 514.01□□□□□ -0.178e-8■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 C16orf52-201ENST00000331057 1359 ntTSL 1 (best)27.75■■■□□ 2.035e-9■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.325e-9■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.045e-9■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.25e-9■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TRIO-224ENST00000620511 1547 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.933e-8■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.083e-8■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 C16orf52-204ENST00000562695 695 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.56e-9■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 C16orf52-203ENST00000562186 605 ntTSL 37.35□□□□□ -1.236e-9■■■■□ 21.6
PCBP2Q15366 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 512.99□□□□□ -0.332e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.482e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 RAP1GAP-209ENST00000471600 3238 ntTSL 511.39□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CERS4-203ENST00000558268 713 ntTSL 323.92■■□□□ 1.422e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CERS4-213ENST00000561053 768 ntTSL 518.74■□□□□ 0.592e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CERS4-211ENST00000560412 568 ntTSL 416.29■□□□□ 0.22e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CERS4-206ENST00000558501 873 ntTSL 516.21■□□□□ 0.192e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CERS4-212ENST00000561008 531 ntTSL 414.14□□□□□ -0.152e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.64e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPS8L2-215ENST00000530093 414 ntTSL 421.76■■□□□ 1.075e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPS8L2-209ENST00000527199 540 ntTSL 320.53■□□□□ 0.885e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPS8L2-210ENST00000527807 814 ntTSL 520.53■□□□□ 0.885e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPS8L2-224ENST00000533500 587 ntTSL 319.9■□□□□ 0.785e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPS8L2-229ENST00000534755 474 ntTSL 418.88■□□□□ 0.615e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPS8L2-203ENST00000524763 580 ntTSL 317.92■□□□□ 0.465e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPS8L2-219ENST00000531348 582 ntTSL 216.66■□□□□ 0.265e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPS8L2-206ENST00000526380 545 ntTSL 315.48■□□□□ 0.075e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPS8L2-214ENST00000529680 551 ntTSL 414.22□□□□□ -0.135e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.014e-8■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.244e-8■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CDHR3-214ENST00000496633 949 ntTSL 57.2□□□□□ -1.264e-8■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 MPHOSPH10-203ENST00000476969 472 ntTSL 26.2□□□□□ -1.427e-7■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CDHR3-202ENST00000461766 536 ntTSL 44.95□□□□□ -1.624e-8■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CIC-205ENST00000573349 927 ntTSL 217.03■□□□□ 0.324e-9■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CIC-206ENST00000575287 846 ntTSL 316.72■□□□□ 0.274e-9■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CIC-209ENST00000576505 1304 ntTSL 316.54■□□□□ 0.244e-9■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 CIC-202ENST00000571033 458 ntTSL 211.56□□□□□ -0.564e-9■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.283e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 UBALD1-207ENST00000591113 659 ntTSL 520.9■□□□□ 0.943e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 SLC9A1-206ENST00000490329 660 ntTSL 213.77□□□□□ -0.216e-8■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 SLC9A1-204ENST00000374089 3165 ntTSL 213.2□□□□□ -0.36e-8■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 IL32-216ENST00000529699 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.894e-38■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 IL32-225ENST00000548246 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.894e-38■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 TNFRSF1A-209ENST00000536717 1503 ntTSL 216.78■□□□□ 0.287e-10■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 TNFRSF1A-215ENST00000543359 627 ntTSL 312.24□□□□□ -0.457e-10■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 AFMID-206ENST00000587750 541 ntTSL 310.66□□□□□ -0.79e-10■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 AFMID-211ENST00000589664 754 ntTSL 510.2□□□□□ -0.789e-10■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 AFMID-203ENST00000585419 493 ntTSL 39.04□□□□□ -0.969e-10■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-216ENST00000531897 785 ntTSL 521.45■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 21.5
PCBP2Q15366 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.953e-6■■■■□ 21.5
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 168.2 ms