Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GBX1Q14549 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms