Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CKAP5Q14008 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CKAP5Q14008 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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