Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPTAN1Q13813 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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